Nowy klub kontynuował udział w rozgrywkach sezonu 1993/1994. Drużyna prowadzona przez Leszka Milewskiego występowała w I lidze serii B i zakończyła sezon na czwartym miejscu. Awans do najwyższej klasy rozgrywkowej nie został wówczas osiągnięty.
W sezonie 1994/1995 Mostostal zakończył rundę zasadniczą I ligi serii B na drugim miejscu, za Legią Warszawa. W barażu o awans do serii A zmierzył się z Włókniarzem Bielsko-Biała. Rywalizacja trwała pięć spotkań i zakończyła się awansem Mostostalu do najwyższej klasy rozgrywkowej.
W sierpniu 1995 roku klub zmienił nazwę na KS Mostostal ZA Kędzierzyn, a współudziałowcem zostały Zakłady Azotowe Kędzierzyn. W sezonie 1995/1996, pierwszym po awansie do serii A, Mostostal zajął siódme miejsce.
Pierwsze sukcesy (1996–1999)
Przełomowym sezonem okazał się sezon 1996/1997. Zespół prowadzony przez Leszka Milewskiego został wzmocniony między innymi przez Sławomira Gerymskiego i Pawła Papkego. W składzie występowali także m.in. Radosław Panas, Rafał Musielak, Bogusław Mienculewicz, Roland Dembończyk i Tomasz Paluch.