Nie ulega wątpliwości, że zarówno nazwa polska, jak i niemiecka związane są z pierwotnymi mieszkańcami tej ziemi – Prusami.
Obecna nazwa została administracyjnie zatwierdzona 7 maja 1946Zarządzenie Ministrów: Administracji Publicznej i Ziem Odzyskanych z dnia 7 maja 1946 r. ()..
Historia Kalendarium thumb|left|Makieta Zamku Biskupów Pomezańskich w Prabutach mały|lewo|Prabucki rynek przed 1914 thumb|left|Pomnik cesarza Wilhelma I na rynku w Prabutach, fot. XIX w. 1233–1283 – podbój terenów Prus przez Zakon Krzyżacki 1236 – pierwsza historyczna wzmianka o pruskim grodzie Resin lub Reizija nad jeziorem Liwieniec, który zostaje zniszczony przez wojska krzyżackie pod wodzą margrabiego Henryka Wspaniałego z Miśni. Na jego miejscu zostaje wzniesiony drewniany zamek. 1250 – utworzenie diecezji pomezańskiej 1255 – Prabuty wraz z okolicznymi terenami przechodzą pod władzę świecką biskupa pomezańskiego 1267–1277 – budowa zamku murowanego. Przy zamku rozwija się osada, która być może już przed 1285 roku, a raczej na pewno między 1305 a 1321 rokiem, otrzymała prawa miejskie (pierwszy przywilej lokacyjny miasta nie zachował się) 1310–1330 – wzniesienie katedry. 1330 – odnowienie przywileju lokacyjnego miasta na prawie chełmińskim.