Pacjenci w cięższym stanie zostali zamordowani, lżej chorzy zostali przeniesieni do szpitala w Starogardzie Gdańskim, gdzie również większość z nich wymordowano 1939 – powstanie oficerskiego obozu przejściowego, do którego 4 października tegoż roku zostaje skierowany major Henryk Sucharski wraz z pozostałymi oficerami z Westerplatte 1945 – wojska sowieckie niszczą ok. 60% miasta„W czasie działań wojennych w 1945 r. miasto uległo zniszczeniu w 60%. Legł w gruzach cały rynek z większością działek w zachodniej i północnej części miasta. Zniszczonych zostało w Prabutach 471 domów.” w: Mówią wieki: magazyn historyczny: tom 12, 1969.. Następuje wysiedlenie niemieckich mieszkańców miasta. W ich miejsce przybywają Polacy ekspatriowani z Kresów Wschodnich, głównie z Wołynia 1946 – miejscowość zostaje włączona do nowo powstałego województwa olsztyńskiego na terenie powojennej Polski pod nazwą Prabuty. Na miejscu szpitala psychiatrycznego powstaje Państwowe Sanatorium Przeciwgruźlicze 1947 – następuje uruchomienie wodociągów, a w 1956 r. linii przesyłowej gazu lata 70 – powstanie w Prabutach nowych zakładów przemysłowych i spółdzielni, m.in.: ZHO Hydroster, Spółdzielni Inwalidów „Świt”, Spółdzielni Odzieżowej „Delta”, Spółdzielni Pracy „Tęcza”, Gminnej Spółdzielni „Samopomoc Chłopska” i zakładów obsługujących rolnictwo (PGR-y).