Carroll należy do fizyków odrzucających pojęcie masy relatywistycznej Sean Carroll, Demystifying Mass , 3:50, kanał 2Veritasium na YouTube, 30 października 2013 [dostęp 2021-01-17]..
Filozofia i religia
Carroll bronił uprawiania filozofii, w odróżnieniu od niektórych innych astrofizyków-popularyzatorów jak Stephen Hawking, Lawrence Krauss i Neil deGrasse Tyson Why Talk to Philosophers? Part I., Rotman Institute of Philosophy, rotman.uwo.ca, 20 czerwca 2014 [dostęp 2022-01-14].. Na swoim blogu nazwał ich wypowiedzi „śmiesznymi” (ang. silly) Sean Carroll, Physicists Should Stop Saying Silly Things about Philosophy, preposterousuniverse.com, 23 czerwca 2014 [dostęp 2022-01-14].. Kilka lat wcześniej uznał światopogląd naturalistyczny za największe osiągnięcie umysłowe ostatniego tysiąclecia; krytykował przy tym opinie Goulda o całkowitej niezależności nauki i religii oraz jego sposób definiowania religii Sean Carroll, Abortion and the Architecture of Reality, preposterousuniverse.com, 4 czerwca 2009 [dostęp 2022-01-14].. Carroll odrzucił zaproszenie Fundacji Templetona, ponieważ nie chciał przyczyniać się do zacierania podziału pomiędzy nauką a religią.