Kursowanie pociągów na odcinku Piła – Wałcz ponownie zawieszono 21 lutego, a na odcinku Kalisz Pomorski – Ulikowo 1 marca 2012. Pierwotny termin przywrócenia kursów, 1 czerwca 2012 roku, został przesunięty o trzy miesiące. Już po przyjęciu rozkładu jazdy pojawiły się trudności z dofinansowaniem przewozów regionalnych. Przesunięcie terminu uruchomienia przewozów pozwoliło PKP PLK na wykonanie dodatkowych prac finansowanych z własnych środków; wzdłuż toru został ułożony kabel światłowodowy. Pozwoliły one m.in. na otwarcie zmodernizowanej nastawni w Kaliszu Pomorskim, która na odcinku z Wałcza do Ulikowa przejęła zdalną obsługę urządzeń sterowania ruchem kolejowymWałcz: Awantura o las.
Od 1 września 2012 wznowiono regularne kursy pociągów w relacji Piła Główna–Szczecin Główny. Po modernizacji maksymalna prędkość dla pociągów pasażerskich została podniesiona z 80 km/h do 100 km/h. W sezonie letnim 2016 r. po linii 403 kursował pociąg pospieszny TLK "Lubomirski" przez Bydgoszcz, Warszawę i Lublin do Przemyśla. Od 11 grudnia 2016 r. tą linią wytrasowano pociąg TLK "Moniuszko" w relacji Szczecin Gł. – Lublin;