Próby odwołania ze stanowiska rektora i dymisja 27 października 2010 r. minister zdrowia Ewa Kopacz zawiesiła Andrzejaka w pełnieniu funkcji rektora i złożyła wniosek o odwołanie go ze stanowiska na podstawie jednoznacznej opinii Zespołu ds. Etyki w Nauce przy Ministerstwie Nauki i Szkolnictwa Wyższego. 5 listopada Senat uczelni wniosek poparł stosunkiem głosów 18:11 przy czterech głosach wstrzymujących się. Rozstrzygnięcie miało nastąpić na zebraniu Kolegium Elektorów uczelni, które odbyło się 28 listopada 2010; tam jednak wniosek o odwołanie Andrzejaka przepadł. Do odwołania potrzebna jest zgoda 75% elektorów, czyli 44 osób, podczas gdy za jego usunięciem zagłosowało 37 osób (19 przeciw, 2 wstrzymały się od głosu). Zarówno sam zainteresowany, jak i p.o. rektora prof. Marek Ziętek uznali wynik za wiążący. 29 listopada Ministerstwo Zdrowia uznało jednak, że głosowanie nie było ważne, ponieważ statutowy skład kolegium liczy 112 osób, a do głosowania wymagana jest obecność co najmniej dwóch trzecich tego składu (77). Podtrzymana została więc decyzja o zawieszeniu Andrzejaka w pełnieniu funkcji do czasu uzupełnienia kolegium. Kolejne głosowanie odbyło się po wyborach uzupełniających do Uczelnianego Kolegium Elektorów. W jego skład weszło 95 elektorów, ponieważ nie udało się obsadzić wszystkich miejsc w Kolegium.