W 2003 roku Winton otrzymał Pride of Britain Award za dokonania całego życia. W 2008 roku szkoła podstawowa w Czechach w miejscowości Kunžak została nazwana jego imieniemMinistry of Defence & Armed Forces of the Czech Republic, dostęp 4 września 2012. W 2008 roku czeski rząd zgłosił kandydaturę Wintona do Pokojowej Nagrody NoblaInformacja w serwisie BBC, dostęp 4 września 2012. W 2010 roku Winton został mianowany przez rząd w Wielkiej Brytanii Brytyjskim Bohaterem Holokaustu. W 2014 roku Winton otrzymał najwyższe odznaczenie Republiki Czeskiej – Order Lwa Białego I Klasy.
Setne urodziny W setną rocznicę urodzin – w 2009 roku – sir Nicholas Winton odbył lot samolotem ultralekkim nad lotniskiem White Waltham. Samolot był pilotowany przez Judy Leden, córkę jednego z chłopców uratowanych podczas KindertransportuBBC News, dostęp 4 września 2012.