Lista awifauny Parku na koniec 2023 roku liczyła 192 gatunki (przy uwzględnieniu jedynie tych gatunków, których obecność uważana jest za naturalną w Polsce), przy czym część z tej liczby to gatunki znane jedynie z pojedynczych obserwacji. M. in. w tymże roku dokonano na terenie TPN pierwszej w historii obserwacji orła cesarskiego. Wśród nich jest 49 gatunków z załącznika 1 Dyrektywy ptasiej UE (w tym 23 lęgowe) oraz 31 gatunków z Polskiej czerwonej księgi zwierząt (w tym 14 lęgowych). Według stanu na 2025 r. zespół ptaków lęgowych polskiej części Tatr liczy 107 gatunków regularnie i prawdopodobnie gniazdujących, co stanowi ok. 46% wszystkich gatunków regularnie lęgowych w granicach Polski.
Wśród ptaków króluje orzeł przedni, który w XIX w. został wytępiony po polskiej stronie Tatr, ale ponownie rozpoczął tu gniazdowanie w roku 1976. W 2025 r. w polskim TPN gniazdowały 3 pary tego gatunku. W tym samym roku stwierdzono na terenie TPN 8-9 par sokoła wędrownego. Siedem z nich odniosło sukces lęgowy, wyprowadzając łącznie 19 młodych. Z sów w 2025 r. na terenie Parku stwierdzono występowanie m.in. puchacza (1-3 terytoria), puszczyka uralskiego (6 terytoriów), włochatki (7-10 par) i sóweczki (45-50 par).