Zarządzeniem Szefa Sztabu Generalnego WP Nr 011/Org. z 16 stycznia 1963 Dowódca Marynarki Wojennej przekazał 3 Pułk Piechoty Morskiej bez batalionu saperów dowódcy Pomorskiego Okręgu Wojskowego. Dowódca POW do 15 marca 1963 przeformował 3 pułk na 93 Pułk Desantowy o etacie 5/345 - 700 żołnierzy, 8 pracowników cywilnych i włączył go w skład 23 Dywizji Desantowej. Ze składu osobowego pułku wydzielono ponadto 29 Kołobrzeski Batalion Saperów, a czołgi przekazano do 11 batalionu czołgów średnich z Słupska (w składzie 23 Dywizji Desantowej).
Struktura organizacyjna pułku Dowództwo i sztabEtat 35/363 batalion piechoty morskiej batalion saperów morskich kompania czołgów (10 czołgów T-34/85M) kompania szkolna artyleria pułkowa plutony: dowodzenia, moździerzy 120 mm, armat przeciwpancernych 85 mm, dział bezodrzutowych 82 mm. bateria artylerii przeciwlotniczej pluton rozpoznawczy pluton transportowo-gospodarczy izba chorych warsztaty Planowana wojenna organizacja pułku znacznie odbiegała od etatu "P". W jego skład miały wejść: Dowództwo i sztab trzy bataliony piechoty morskiej kompania czołgów kompania rozpoznawcza artyleria pułku: bateria artylerii dział kal.