Został uznany za „ojca hetytologii”.
Podjął się próby odczytania pisma linearnego B i pisma protoindyjskiego – w obu wypadkach popełnił szereg błędów i nie odniósł sukcesu.
Na rok akademicki 1939/1940 został wybrany na stanowisko rektora Uniwersytetu Karola. W początkach wojny zaangażował się on w ratowanie studentów i pracowników, a także zbiorów i wyposażenia uniwersytetu, później wycofał się z życia publicznego z uwagi na podupadające zdrowie. W 1944 roku doznał udaru mózgu, co uniemożliwiło mu powrót na uczelnię po zakończeniu wojny. W 1952 roku wybrano go na członka Czechosłowackiej Akademii Nauk.
Hrozný zmarł 12 grudnia 1952 roku w Pradze.
Publikacje Lista publikacji podana za Hadler (2016): 1902 – Zum Geldwesen der Babylonier 1903 – Vznik mythu o Leviatanovi [Die Entstehung des Mythos vom Leviathan] 1903 – Sumerisch-babylonische Mythen von dem Gotte Ninrag (Ninib) 1913 – Das Getreide im alten Babylonien. Ein Beitrag zur Kultur- und Wirtschaftsgeschichte des alten Orients 1915 – Die Lösung des hethitischen Problems. Ein vorläufiger Bericht 1917 – Die Sprache der Hethiter, ihr Bau und ihre Zugehörigkeit zum indogermanischen Sprachstamm.