Został pochowany na cmentarzu parafii św. Michała Archanioła w Mszanie Dolnej.
Upamiętnienie
Imię Sebastiana Flizaka nosi ulica w Mszanie Dolnej.
W dniu 16 grudnia 2019 r. na budynku Zespołu Szkół Techniczno-Informatycznych przy ul. Matejki 11 w Mszanie Dolnej odsłonięto tablicę pamiątkową poświęconą pamięci Sebastiana Flizaka oraz odbyła się promocja książki autorstwa dr. Katarzyny Ceklarz pt. Sebastian Flizak. Ludoznawca i etnograf na tle swojej epoki. Tablicę odsłonił spokrewniony z Flizakiem wójt gminy Niedźwiedź Rafał Rusnak.
Publikacje Wspomnienia o Wł. Orkanie. Odczyt Odczyt wygłoszony na posiedzeniu Koła T.N.S.W. dnia 25 maja 1930 w Sanoku, Lwów 1930, ss. 30. Notatki etnograficzne z okolic Mszany Dolnej, „Lud” 1934/1935, t. 33, s. 21-27. Ekspansja podhalańskiej kultury ludowej, „Lud” 1936, t. 34, s. 296-271. Z życia owczarzy gorczańskich, „Wierchy” 1936, t. 14, s. 69-80. Z dziejów sądownictwa dworskiego (cz. I), „Piast” 1936, nr 29, s. 5. Z dziejów sądownictwa dworskiego (cz. II), „Piast” 1936, nr 31, s. 4. Z dziejów sądownictwa dworskiego (cz. III), „Piast” 1936, nr 32, s. 6. Z dziejów sądownictwa dworskiego (cz. IV), „Piast” 1936, nr 33, s. 4. Moda w nadawaniu imion chrzestnych u górali pod Gorcami, „Lud” 1937, t. 15, s. 55-59. Dziadowskie obiady, „Lud" 1937, t. 15, s.