Inną przyczyną może być wysokie podobieństwo strukturalne niektórych aminokwasów przez co mogą być one omyłkowo włączone do białek, np. , będąca bliskim analogiem argininy, jest z tego powodu wysoce toksyczna.
Ze względu na zdolność organizmu do syntezy danego związku wyróżnia się aminokwasy endogenne i egzogenne.
D-Aminokwasy Mimo że w przyrodzie dominują L-aminokwasy, spotyka się także ich enancjomery o konfiguracji D. Występują one naturalnie, na przykład w mikroorganizmach, roślinach i bezkręgowcach morskich. Powstają także podczas obróbki żywności, w wyniku racemizacji L-aminokwasów. Białka zawierające reszty D-aminokwasowe są gorzej trawione i mają niższą wartość odżywczą. Aktywność biologiczna D-aminokwasów różni się od naturalnych enancjomerów L, przy czym niektóre D-aminokwasy wywierają korzystny wpływ na organizm człowieka, a inne szkodliwy.
Kanoniczne aminokwasy białkowe +Właściwości fizykochemiczne 20 aminokwasów kanonicznych Skrót 1-lit. Skrót 3-lit. Nazwa Wzór strukturalnyPolarność ł.b.Łańcucha bocznego.