W 2017 otrzymał tytuł Honorowego Obywatela Miasta Tarnowa.
Jest autorem książki „Aptekarstwo polskie na obszarze byłej Galicji w świetle obowiązującego ustawodawstwa z lat 1772–1914” i współautorem „Tarnów – Stare Miasto” cz. I.
Jerzy Pertkiewicz zmarł 30 czerwca 2018 roku, w wieku 98 lat. Uroczystości pogrzebowe odbyły się 4 lipca 2018 roku na Starym Cmentarzu w Tarnowie.
thumb|240px|Nominacja (2011) na stopień pułkownika thumb|240px|Przyznanie statuetki „Orły Niepodległości”
W kulturze Osoby aptekarzy: Zygmunta i Jerzego Pertkiewiczów (ojca i syna) są głównymi bohaterami filmu fabularnego Pan Apotheker w reżyserii Dawida Szpary. Zdjęcia do filmu kręcono w grudniu 2018 w Małopolsce, a premiera odbyła się w kinie Marzenie w Tarnowie 21 grudnia 2019https://www.se.pl/tarnow/ireneusz-pastuszak-zagra-glowna-role-w-filmie-akcja-dzieje-sie-w-tarnowie-aa-bzHj-YeYa-uCJo.html [dostęp 2020-02-28]http://www.rdn.pl/kultura/pan-apotheker-powstal-film-o-tarnowskim-farmaceucie [dostęp 2020-02-28]https://gazetakrakowska.pl/tarnow-opowiesc-wigilijna-rodem-z-tarnowa-na-duzym-ekranie-pan-apotheker-premiere-mial-w-kinie-marzenie-zdjecia/ar/c1-14673621 [dostęp 2020-02-28]. W filmie wystąpili m.in.