Etap 4 – 17 września 2008 : Bielsk Podlaski Siemiatycze > Lublin, 243,6 km 203,3 km W etapie tym, kolarze po przejechaniu dwóch okrążeń ulicami Lublina, zatrzymali się na linii mety jedno okrążenie (4,6 km) przed regulaminowym zakończeniem etapu. Dyrekcja wyścigu za zgodą komisji sędziowskiej i stosownie do artykułu 2.2.029 regulaminu UCI zdecydowała uznać etap za nieważny. W konsekwencji wszelkie klasyfikacje tego etapu zostały anulowane, wszystkie nagrody przewidziane na 4 etapie nie zostały przyznane, a bonifikaty za lotne premie były unieważnione. W związku z tym wszystkie klasyfikacje po 3 etapie z dnia 16.09.2008 pozostały niezmienione Źródło..
Generalna Klasyfikacja po 3 etapie (Żółta koszulka): KolarzKrajZespółCzas1Allan DavisQuick Step – Innergetic 10h 41' 47"2Murilo Antonio FischerLiquigas + 4"3Lars Ytting BakTeam CSC + 7"4Fränk SchleckTeam CSC + 7"5Andy SchleckTeam CSC + 7"
Etap 5 – 18 września 2008: Nałęczów > Rzeszów, 239,7 km.