II wojna światowa W sierpniu 1939 został zmobilizowany i otrzymał przydział do batalionu marszowego 43 pp. w Włodzimierzu Wołyńskim. Brał udział w kampanii wrześniowej, 25 września dostał się do niewoli radzieckiej pod Rawą Ruską jako zwykły żołnierz. 1 listopada, jako jeniec, został przekazany Niemcom.
Pod koniec sierpnia 1940 jako chory na płuca i niezdolny do pracy został zwolniony z niewoli niemieckiej. Powrócił do Dębieńska i przez kilka miesięcy leczył się w domu. Pod koniec 1940 skontaktowali się z nim jego dawni podwładni ze Straży Granicznej: Józef Bienek i Stanisław Kubiaczyk. Na tym spotkaniu ustalono, że w środowisku przedwojennych strażników granicznych powstanie tajna organizacja, która docelowo obejmie również inne środowiska. Początkowo akcja werbunkowa postępowała opieszale: Spyra, wycieńczony pobytem w stalagu, był wciąż przykuty do łóżka, Kubiaczyk ostatecznie nie zgłosił akcesu do organizacji. Jedynie Bienek dość aktywnie nawiązywał kontakty wśród sprawdzonych i zaufanych ludzi. Jednak mimo starań Bienka, organizacja ta nie wyszła poza stadium tworzenia struktur. We wrześniu 1942 pogranicznicy weszli w struktury Armii Krajowej.