Wydanie Mother 3 został wydany w Japonii 20 kwietnia 2006 roku, gdzie stał się jedną z najlepiej sprzedających się gier z tamtego roku. Przed wydaniem gra była jedną z „pięciu najbardziej upragnionych gier” według magazynu „Famitsu” i na szczycie japońskich gier zamówionych w przedsprzedaży.
thumb|Ostrzeżenie występujące przed fanowskim tłumaczeniem gry Mother 3. Gra nigdy nie została oficjalnie wydana poza Japonię. Imran Khan z portalu „Game Informer” spekulował, że brak oficjalnej anglojęzycznej wersji był spowodowany obawą przed kontrowersjami z powodu tematyki żałoby, zażywania narkotyków oraz przemocy wobec zwierząt. Były szef amerykańskiego oddziału Nintendo, Reggie Fils-Aimé stwierdził w wywiadzie z „Bloomberg News”, że dystrybucja Mother 3 poza Japonię nie miała sensu z biznesowego punktu widzenia. 17 października 2008 roku strona Starmen.net opublikowała fanowskie tłumaczenie gry na język angielski. Portal „The Verge” określił je jako przykład fanowskiego zaangażowania, z kolei Jenni Lada z „TechnologyTell” nazwała je „jednym z najbardziej zauważalnych fanowskich tłumaczeń”.
Odbiór