Kariera trenerska W 1991 roku Brady został menedżerem Celtiku - ósmym w historii klubu, ale pierwszym, który wcześniej, jako zawodnik, nie był związany z The Bhoys. Ze szkockim klubem nie osiągnął sukcesów, natomiast zanotował jedną z najbardziej kompromitujących porażek. W II rundzie Pucharu UEFA sezonu 1991/92 Celtic przegrał na wyjeździe ze szwajcarskim Neuchatel Xamax 1:5 i odpadli z rozgrywek, bowiem w rewanżu zwyciężyli zaledwie 1:0.
W 1993 roku objął stery w Brighton & Hove Albion F.C., gdzie również pracował przez dwa sezony.
Od lipca 1996 do maja 2014 kierował młodzieżową akademią Arsenalu. W tym czasie drużyna U-18 tego klubu zdobyła trzykrotnie FA Youth Cup (2000, 2001, 2009) i dwukrotnie zwyciężyła w rozgrywkach Premier Academy League (2009, 2010). Jego zawodnikami byli m.in. Jack Wilshere, Kieran Gibbs, Ashley Cole, Cesc Fàbregas i Wojciech Szczęsny. W 2015 powrócił do klubu, jak jeden z jego ambasadorówLiam Brady to leave Arsenal academy role in May 2014John Cross Arsenal legend Liam Brady to return to club in ambassadorial role 17 months after departureLiam Brady interview: The kid that had it all.