Od 2004 roku uczelnia funkcjonuje pod obecną nazwą.
Wydziały MRU Uniwersytet Michała Römera posiada obecnie sześć wydziałów oraz dwa instytuty: thumb|Budynek główny uniwersytetu thumb|Instytut Medycyny Sądowej MRU Jednostka Katedry Dziekan Wydział Ekonomii i Finansów Bankowości i Inwestycji Ekonomii Finansów i Podatków Handlu Międzynarodowego i Ceł Ekonomiki Przedsiębiorstwa prof. doc. dr Rima Žitkienė Wydział Prawa Prawa Administracyjnego Postępowania Karnego Kodeksu Karnego i Kryminologii Prawa Cywilnego i Handlowego Postępowania Cywilnego Prawa Pracy i Ubezpieczenia Społecznego Prawa Konstytucyjnego Prawa Międzynarodowego i Unii Europejskiej Filozofii i Historii Prawa Prawa Gospodarczego Prawa Porównawczego prof. dr Egidijus Jarašiūnas Wydział Polityki i Zarządzania Ochrony Środowiska Nauk Politycznych Zarządzania Strategicznego Zarządzania Administracji Państwowej dr Algirdas Monkevičius Wydział Bezpieczeństwa Publicznego Kryminalistyki i Postępowania Karnego Nauk Humanistycznych Prawa Treningu Fizycznego Czynności Policyjnych Obrony Granic doc.