a) Oznaczenia: M – mistrz kraju z sezonu 2003/2004 (NSL), Z – zwycięzca sezonu zasadniczego 2003/2004 (NSL). b) Cztery najlepszy drużny awansowały do serii finałowej rozgrywek. c) Awans do Azjatyckiej Ligi Mistrzów 2007 (ACL): Australia przystąpiła do konfederacji Asian Football Confederation (AFC) w 2006 roku. AFC zadecydowała po zakończeniu sezonu, że mistrz Australii 2005/2006 i zwycięzca sezonu zasadniczego 2005/2006 przystąpią do Azjatyckiej Ligi Mistrzów od 2007 roku.
Miejsca po danych kolejkach Drużyna / Kolejka 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 Adelaide United 2 4 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 Sydney FC 4 1 2 4 4 2 2 3 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 Central Coast Mariners 2 3 6 3 2 5 6 4 6 4 7 7 5 6 5 4 3 4 4 3 3 Newcastle Jets6 7 5 2 3 6 7 6 4 5 3 4 4 3 3 3 4 3 2 4 4 Perth Glory6 6 4 6 5 7 4 7 5 6 4 3 3 4 4 5 5 6 5 6 5 Queensland Roar 1 2 3 4 7 4 5 5 7 7 5 6 7 7 7 7 6 7 6 5 6 Melbourne Victory 4 5 8 7 6 3 3 1 3 3 6 5 6 5 6 6 7 5 7 7 7 New Zealand Knights8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
Seria finałowa
Ćwierćfinał
Ćwierćfinał (rewanże)
Półfinał
Grand Final