Historia Herediano powstał 21 czerwca 1921 w wyniku fuzji klubów piłkarskich Club Sport Renacimiento, Club Sport Juan J. Flores oraz Club Sport Cristóbal Colón. Akt założycielski podpisali piłkarze różnych klubów (takich jak La Libertad czy Gimnástica Española): José Joaquín „Toquita” Gutiérrez, Eladio Rosabal Cordero, Víctor Manuel Ruiz, Gilberto i Claudio Arguedas oraz Luis Valerio.
Klub już 1 lipca 1921 zakupił teren pod boisko piłkarskie oraz w tym samym roku wywarł presję na rząd kostarykański, by doprowadzić do utworzenia kostarykańskiej federacji piłkarskiej (Federación Costarricense de Fútbol). Następnie szybko doprowadzono do organizacji pierwszych mistrzostw Kostaryki, wygranych przez Herediano.
W 1925 Herediano rozegrał pierwsze mecze międzynarodowe – stało się to podczas wojażu na Jamajkę, gdzie drużyna z Kostaryki rozegrała 6 meczów, z których 4 wygrała, 1 zremisowała i 1 przegrała.
W 1928 Herediano udał się na tournée po Salwadorze, gdzie rozegrał kilka meczów z miejscowymi klubami. Dwukrotnie pokonał drużynę Cuscatlán – 11:0 i 11:1.