Był to także pierwszy lot z wykorzystaniem jednostki Instrument Unit, sterującej rakietami Saturn podczas startu i podczas pierwszego startu rakiety Saturn IB ze stanowiska Pad 37B, pierwszy lot orbitalny stopnia S-IVB oraz pierwszy lot nowej, lżejszej wersji pierwszego stopnia rakiety (S-IB).
thumb|200px|left|Start AS-203
Przygotowania Wiosną 1966 zdecydowano, że AS-203 poleci przed AS-202 (z powodu opóźnień w przygotowaniu modułu serwisowego dla 202). Człony rakiety S-IVB zostały dostarczone na kosmodrom 6 kwietnia 1966. Pierwszy człon S-IB został dostarczony sześć dni później, jednostka Instrument Unit, kolejne dwa dni później.
19 kwietnia technicy zaczęli wznosić wyrzutnię na stanowisku nr 37B. Procedura kontrolna wykazała problemy podobne jak w przypadku lotu AS-201. Przyczyną awarii okazały się być wadliwe połączenia lutowane na drukowanych płytkach połączeń elektrycznych.
W czerwcu rakiety Saturn ustawiono na wyrzutniach kosmodromu. Na wyrzutni nr 34 stanął AS-202, na wyrzutni nr 37B stanął AS- 203.