Początkowo pociągi Myślęcińskiej Kolejki Parkowej kursowały na trasie o długości ok. 1,5 km: Bydgoszcz Las Gdański (przy pętli tramwajowej linii 1 i 2) – Bydgoszcz Myślęcinek, wzdłuż ul. Gdańskiej. Na stacjach końcowych znajdowały się mijanki dla objeżdżania składu przez lokomotywę, a jednostanowiskowa lokomotywownia była położona przy stacji w Myślęcinku. Tor ułożono na podkładach betonowych, a niektóre z użytych szyn miały sygnatury z pierwszej dekady XX wieku. W okolicy stacji końcowej w Myślęcinku znajdowały się tereny rekreacyjne Leśnego Parku Kultury i Wypoczynku w postaci m.in. ogrodu zoologicznego. Kolej jeździła w sezonie od wiosny do jesieni. Pociągi kursowały cały tydzień w godzinach 11:00–20:00 (w poniedziałki od 13:00). Według stanu na 2000 rok wyjeżdżały ze stacji Bydgoszcz Las Gdański o pełnej godzinie i z Myślęcinka 40 minut później, a bilet normalny kosztował 2,50 zł.