31 sierpnia i 1 września 2000 odbył się kolejny dwudniowy koncert zespołu w Nippon Budōkan. W 2001 członkowie zespołu wystąpili w pełnometrażowym filmie Bara no Konrei ~Mayonaka ni Kawashita Yakusoku~, będącym ekranizacją powieści Drakula. W tymże roku grupa wydała trzy single: „Gardenia”, „Beast of Blood” i „Garnet ~Kindan no Sono E~”. 11 grudnia 2001 zespół ogłosił zawieszenie działalności.
Późniejsze projekty Po rozpadzie Malice Mizer, członkowie zespołu zaczęli prace nad swoimi indywidualnymi projektami. Mana założył zespół Moi dix Mois, a także kontynuował rozpoczętą w 1999 karierę projektanta mody wraz ze swoją firmą Moi-même-Moitié, tworząc ubrania w stylu Gothic Lolita. Közi uczestniczył w pracach kilku projektów muzycznych, między innymi: Eve of Destiny, ZIZ, Vamquet, XA-VAT, Mayohk. Yu~ki nie kontynuował kariery muzycznej i zajął się produkcją biżuterii. Gaz, pierwszy perkusista zespołu, zmarł w 2017.
Wszyscy trzej wokaliści zespołu rozpoczęli projekty solowe. Tetsu był wokalistą kilku zespołów, w tym Zigzo i nil. Gackt odniósł największy sukces komercyjny w swojej karierze solowej i stał się jedną z najbardziej rozpoznawalnych postaci japońskiej popkultury. Klaha zakończył działalność publiczną w 2004.