Sébastien Fournier (ur. 27 czerwca 1971 w Nendaz) – szwajcarski piłkarz grający na pozycji środkowego pomocnika.
Kariera klubowa Fournier był wychowankiem klubu FC Sion. W sezonie 1987/1988 zadebiutował w jego barwach w szwajcarskiej pierwszej lidze. Swoje pierwsze sukcesy w tym klubie osiągnął w sezonie 1990/1991, gdy wywalczył ze Sionem wicemistrzostwo Szwajcarii. Zdobył także Puchar Szwajcarii, dzięki zwycięstwu 3:2 w finale nad BSC Young Boys. W sezonie 1991/1992 był już podstawowym zawodnikiem Sionu i wywalczył z tym klubem pierwsze w historii mistrzostwo Szwajcarii. Swój kolejny sukces Sébastien osiągnął w 1995 zdobywając po raz kolejny krajowy puchar, a rok później obronił to trofeum. W 1996 roku odszedł z zespołu.
Następnym klubem w karierze Fourniera był niemiecki VfB Stuttgart. W niemieckiej Bundeslidze Szwajcar zadebiutował 8 września 1996 roku w wygranym 4:0 domowym spotkaniu z 1. FC Köln. W 81. minucie spotkania zmienił Gerharda Poschnera. Nie potrafił jednak przebić się do podstawowego składu zespołu prowadzonego przez Joachima Löwa i w całym sezonie 1996/1997 rozegrał tylko 11 spotkań i w lecie 1997 powrócił do ojczyzny.