Po stłumieniu Powstania Słowackiego na pocz. listopada 1944 r., oddziały POHG zostały przeorganizowane. Część z nich wysłano na szkolenie do Niemiec, po zakończeniu którego przeformowano w pułk grenadierów Waffen-SS i włączono w skład SS-Kampfverband „Wallenstein” jako Slowakei Grenadier Regiment Nr. 1 „Hlinka Garde” pod dowództwem SS-Obersturmbannführera Waltera Demesa. Pozostałe oddziały wraz z niemieckimi oddziałami okupacyjnymi aktywnie zwalczały partyzantkę. Represjonowały też ludność cywilną podejrzaną o pomoc lub sprzyjanie partyzantom.
Oblicza się, że żołnierze oddziałów POHG odpowiadają za śmierć ok. 4 tys. cywilów. Wiele tysięcy ludzi skierowali do obozów koncentracyjnych. Szczególnie złą sławę zyskała 5 kompania polowa POHG (ok. 150 ludzi) pod dowództwem ppor. Jozefa Nemsili, stacjonująca w miejscowości Považská Bystrica. Po zakończeniu wojny wielu b. żołnierzy POHG zostało aresztowanych i skazanych na karę śmierci, np. gen. O. Kubala. Niektórym udało się zbiec na Zachód, np. ppor. J. Nemsili.