W drugim etapie 56 klubów podzielono na 7 grup po 8 klubów. Pozostałe 2 kluby – SE Palmeiras i Guarani FC – awansowały do trzeciego etapu bez gry. Ponieważ z każdej grupy do trzeciego etapu awansowały 2 najlepsze kluby, łącznie w trzecim etapie znalazło się 16 klubów, które podzielono na 4 grupy po 4 kluby. Do półfinału awansowali tylko zwycięzcy grup. W półfinale i finale grano systemem pucharowym mecz i rewanż.
Pierwszy etap Grupa A Mecze chronologicznie DataMecz22 września 1979Goiânia – Avaí FC 1:1Pedro Ornelas - Zé Paulo23 września 1979AD Confiança – Londrina 2:1Nininho, Deca - Paulinho23 września 1979AA Anapolina – CS Sergipe 2:0Zé Carlos Paulista, Jorge Cruz25 września 1979AA Anapolina – Avaí FC 2:1Maurício, Sídnei - Bira Lopes25 września 1979Joinville – EC Juventude 2:1Francisco, Vanil - Lula26 września 1979Goiânia – CS Sergipe 1:1Pedro Ornelas - Mica30 września 1979Joinville – Novo Hamburgo 3:0Mateus (2), Sídnei30 września 1979Colorado EC – AD Confiança 1:1Jorge Nobre - Deca30 września 1979Avaí FC – Londrina 1:1Fico - Marinho30 września 1979EC Juventude – AA Anapolina 2:0Cacau, Lula3 października 1979Londrina – AA Anapolina 1:0Paulinho4 października 1979Colorado EC – Joinville 1:0Tiăo Marçal6 października 1979EC Juventude – Colorado EC 0:06 października 1979AD Confiança – Goiânia 0:1Divino6 października