Plan kościoła, w stylu gotyckim, był autorstwa architekta Edwarda Cichockiego z Warszawy. W 1918 roku, rozporządzeniem biskupa włocławskiego Stanisława Zdzitowieckiego, erygowano nową parafię w Ciechocinku. Okręg parafialny utworzyły: Ciechocinek, Nowy Ciechocinek, Słońsk Dolny, Słońsk Górny, Wołuszewo, Wygoda. Pierwszym proboszczem parafii został ksiądz Jan Sowiński. W czasie II wojny światowej kościół w Ciechocinku był dostępny jedynie dla katolików niemieckich. W czasie działań wojennych kościół parafialny został uszkodzony. Zaraz po wojnie, bo już w 1949 roku, zakończono remont kościoła, m.in. odrestaurowano organy, a w 1954 roku założono w kościele centralne ogrzewanie oraz wymieniono zniszczone cegły i dachówki. W latach 80. XX wieku rozbudowano kościół, a w latach 90. XX wieku przeprowadzono kolejne prace remontowe. W lutym 2000 roku dzwony kościelne i zainstalowano nowe nagłośnienie. Latem 2002 roku zostały uzupełnione ubytki cegieł oraz naprawiono uszkodzoną blachę miedzianą. W latach 2003–2004 kościół został wyposażony w nowe ławki i konfesjonały, a w 2005 roku ponownie zostały wyremontowane organy.
Obecnie proboszczem parafii jest ksiądz prałat honorowy Grzegorz Karolak.