W marcu 2001, World Wrestling Federation (WWF) zakupiło World Championship Wrestling. Niedługo później odbył się storyline "The Invasion" (związany z wrestlerami z WCW/ECW), gdzie grupa The Alliance ostatecznie została rozwiązana. Po gali Survivor Series 2001, nazwa tytułu została zmieniona na WWF Cruiserweight Championship, tym samym dezaktywując WWF Light Heavyweight ChampionshipWWE: Inside WWE > Title History > Light Heavyweight.. Po zmianie nazwy z World Wrestling Federation na World Wrestling Entertainment w 2002, akronim tytułu również został zmieniony na WWE. Tego samego roku, mistrzostwo stało się ekskluzywne dla brandu SmackDown.
28 września 2007, tytuł został zawieszony po tym jak ostatni mistrz, Hornswoggle, został pozbawiony tytułu przez generalną menadżerkę SmackDown Vickie Guerrero. Hornswoggle wygrał mistrzostwo w Cruiserweight Open na tegorocznej gali The Great American Bash. Ostatni raz tytuł był broniony 31 sierpnia na tygodniówce SmackDown, gdzie Hornswoggle pokonał Jamiego Noble’a.
3 marca 2008, WWE usunęło mistrzostwo z listy aktywnych na swojej oficjalnej stronie, gdzie przez pół roku znajdował się jako „zwakowany”. Tuż po tym, tytuł został przeniesiony do strony z nieaktywnymi mistrzostwami.