100 atomów w cząsteczce, średniocząsteczkowe – liczące od 100 do 1000 atomów, wysokocząsteczkowe (makromolekuły) – liczące powyżej 1000 atomówDefinicja makromolekuły według IUPAC..
Ze względu na dominujący rodzaj wiązań chemicznych występujących między atomami tworzącymi cząsteczki, związki chemiczne dzieli się na: jonowe – w których dominują wiązania jonowe kowalencyjne – w których dominują wiązania kowalencyjne kompleksowe – w których występują wiązania koordynacyjne Układy cząsteczek powiązane wiązaniami wodorowymi uważa się, zależnie od sytuacji i kontekstu czasami związkami chemicznymi a czasami strukturami nadcząsteczkowymi.
Jeszcze inny podział związków chemicznych wywodzi się z istnienia dwóch wielkich działów chemii: organicznej i nieorganicznej: Związki organiczne są to połączenia węgla, wodoru i innych pierwiastków, poza kwasem węglowym i jego pochodnymi. Wszystkie pozostałe związki przyjęło się nazywać związkami nieorganicznymi. Na styku tych dwóch wielkich grup znajdują się związki metaloorganiczne oraz związki kompleksowe, zawierające ligandy organiczne.
Wreszcie, ze względu na ich ogólną reaktywność, związki chemiczne można podzielić na: ze względu na kwasowość: kwasy zasady związki amfoteryczne