Służba Morze Północne i północny Atlantyk 1939–1940 „Edinburgh” wszedł do służby tuż przed wybuchem II wojny światowej i początkowo został przydzielony do 18. Eskadry Krążowników Floty Metropolii (18th Cruiser Squadron Home Fleet) bazując w Scapa Flow. W pierwszym okresie wojny głównie brał udział w patrolach ciężkich okrętów na północno-zachodnich podejściach do Wysp Brytyjskich (NW Approaches), przeciw niemieckim rajderom i żegludze. 1 października został przydzielony od 2. Eskadry Krążowników (w 18. Eskadrze zastąpił go HMS „Suffolk”). W kolejnych miesiącach głównie poszukiwał bezskutecznie z innymi krążownikami niemieckich rajderów na Morzu Północnym. 16 października 1939 został lekko uszkodzony odłamkami podczas niemieckiego nalotu na okręty w bazie Firth of Forth, wyremontowany do końca miesiąca. Zginęły dwie osoby na pokładzie krążownikaDon Kindell, Casualty Lists of the Royal Navy and Dominion Navies, World War 2. 1st – 31st OCTOBER 1939.. Od połowy listopada bazował w estuarium Humber, działając głównie na Morzu Północnym. 23 listopada poszukiwał bezskutecznie z krążownikami HMS „Southampton” i HMS „Aurora” i 3 niszczycielami pancerników „Scharnhorst” i „Gneisenau” po zatopieniu przez nie krążownika pomocniczego HMS Rawalpindi.