Po wojnie świątynia służyła m.in. przez lata jako kaplica przedpogrzebowaOryginalny dom przedpogrzebowy. Piramida w Braniewie [w:] IKAT. Gazeta Braniewska, 21 marca 1997. Od 1992 cerkiew służy wiernym obrządku greckokatolickiego, którym została przekazana po długich sporach. Oficjalne przekazanie miało miejsce w niedzielę 16 lutego 1992. Inaugarycyjną mszę świętą odprawił bp Jan Martyniak, ordynariusz greckokatolicki diecezji przemyskiej. Na mszy obecnych było ponad 300 wiernychKościół przekazany [w:] Ilustrowany Kurier Terenowy, nr 4 (26), 15–29 lutego 1992.
Od 1 listopada 2016 z powodu złego stanu technicznego ściany frontowej, grożącej zawaleniem, świątynia została przez nadzór budowlany zamknięta, gdyż na ścianie frontowej pojawiły się niebezpieczne spękania. W 2017 zostały przeprowadzone prace remontowe w świątyni, m.in. pęknięcia zostały spięte specjalnymi klamrami i pouzupełniane ubytki w murze. Koszt napraw wyniósł 157 tys. złotych. Ministerstwo Kultury i Dziedzictwa Narodowego przyznało dotację w wysokości 100 tys.