Zainteresowania badawcze Pierwotnie zajmował się stosunkami polsko-kozackimi. Przedstawił genezę i upadek unii hadziackiej. Zajmował się też stosunkami polsko-szwedzkimi i polsko-francuskimi w XVII wieku. Po II wojnie światowej z powodów politycznych zajął się historią sztuki (w 1952 zmuszony do przejścia do Instytutu Historii Sztuki UW). Badał historię i kulturę nowożytną, sztukę baroku i mecenat artystyczny.
Ordery i odznaczenia Krzyż Oficerski Orderu Odrodzenia Polski (29 października 1947) Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski Złoty Krzyż Zasługi Złota odznaka honorowa „Za Zasługi dla Warszawy” (1966)
Publikacje Bibliografia prac Jerzy Kowalczyk, Bibliografia publikacji prof. dr Władysława Tomkiewicza, [w:] Sarmatia artistica. Księga pamiątkowa ku czci profesora Władysława Tomkiewicza, red. Jan Białostocki, Warszawa 1968, s. 7–15. Jerzy Kowalczyk, Bibliografia prac prof. dr Władysława Tomkiewicza, red., oprac., uzup. Marianna Banacka, „Biuletyn Historii Sztuki” 54 (1992) nr 4, s. 129–137.