W 1936 roku dyrekcja została przekształcona w Okręg Pomorski z siedzibą Dyrekcji Lasów Państwowych w Toruniu.
W czasie drugiej wojny światowej zarząd nad dyrekcją przejęła administracja niemiecka. Rabunkowa gospodarka tego zarządu, spowodowała duże straty w zasobach leśnych wynoszące ok. 41 tys. ha powierzchni lasów. W lutym 1945 roku rozpoczęto prace mające na celu odbudowę i organizację Dyrekcji Lasów Państwowych w Toruniu. Po tym okresie nastąpiło jeszcze wiele zmian strukturalnych powodujących m.in. zmianę powierzchni i liczbę nadleśnictw. Ostatnia zmiana nastąpiła w roku 1991. Wówczas została utworzona Regionalna Dyrekcja Lasów Państwowych w Toruniu.
Dyrektorzy Dyrektorzy RDLP w Toruniu: Teofil Lorkiewicz (1925–1931) Józef Zagórski (1931–1934) Władysław Chwalibogowski (1934–1939) Mieczysław Niezabitowski (1945–1948) Stefan Jabłoński (1948–1950) Franciszek Kryczko (1950) Wilhelm Jankowski (1950–1961) Stefan Niedzielski (1961–1981) Zygfryd Kowalski (1982–1990) Grzegorz Majchrzak (1991–1992) Janusz Kaczmarek (1992–1994, 1997–2001, 2005–2018) Wojciech Wieciński (1994–1997, 2001–2002) Feliks J.