Rybactwa Śródlądowego Instytut Sadownictwa i Kwiaciarstwa (razem z Instytutem Warzywnictwa tworzy Instytut Ogrodnictwa od 1 stycznia 2011) Instytut Technologiczno-Przyrodniczy (do 2010 r. Instytut Budownictwa, Mechanizacji i Elektryfikacji Rolnictwa i Instytut Melioracji i Użytków Zielonych) Instytut Uprawy, Nawożenia i Gleboznawstwa Instytut Warzywnictwa (razem z Instytutem Sadownictwa i Kwiaciarstwa tworzy Instytut Ogrodnictwa od 1 stycznia 2011) Instytut Zootechniki Morski Instytut Rybacki Państwowy Instytut Weterynaryjny Spółdzielczy Instytut Badawczy
Ministerstwo Skarbu Państwa Ośrodek Badawczo-Rozwojowy Sprzętu Mechanicznego
Ministerstwo Sportu i Turystyki Instytut Sportu
Ministerstwo Spraw Wewnętrznych i Administracji Centrum Naukowo-Badawcze Ochrony Przeciwpożarowej – Państwowy Instytut Badawczy im. Józefa Tuliszkowskiego Instytut Technologii Bezpieczeństwa „Moratex”
Ministerstwo Spraw Zagranicznych Instytut Zachodni – Instytut Naukowo-Badawczy im. Zygmunta Wojciechowskiego
Ministerstwo Sprawiedliwości Instytut Ekspertyz Sądowych im. prof. dr.