Wybory prezydenckie w Macedonii odbyły się w dwóch turach 22 marca i 5 kwietnia 2009. Nowym prezydentem Macedonii został Ǵorge Iwanow. Pierwsza tura wyborów odbywała się równocześnie z wyborami samorządowymi.
W pierwszej turze wyborów zwyciężył Ǵorge Iwanow (WMRO-DPMNE), na którego głosowało 35,06% wyborców. Drugie miejsce zajął Lubomir Frczkoski (Socjaldemokratyczny Związek Macedonii), który zdobył 20,45% głosów. Trzeci był były minister zdrowia Imer Selmani (Nowa Demokracja), który otrzymał 14,99% głosów, a czwarte miejsce zajął niezależny kandydat Lube Boszkoski (14,87%). Frekwencja w pierwszej turze wyniosła 57%.
W drugiej turze wyborów zwyciężył ponownie Ǵorge Iwanow. Uzyskał on wynik 63,14% głosów. Frekwencja przekroczyła wymagane 40% i wyniosła 42,89%.
Przed wyborami W październiku 2008 parlament zaakceptował poprawki do konstytucji, przewidujące zmianę zasad głosowania w wyborach prezydenckich. Parlament obniżył minimalną wymaganą frekwencję podczas wyborów prezydenckich z 50% do 40%. Była to próba polepszenia wizerunku Macedonii jako kraju o stabilnej demokracji. Wybory powszechnie były oceniane jako „test dojrzałości politycznej” Macedończyków, mogący zadecydować o członkostwie kraju w Unii Europejskiej i NATO.