Kolejną pozycją w ich karierze była płyta I Am Not a Doctor (1998), ale przełom stanowiła dopiero popowa Things to Make and Do (2000), rozsławiona remiksem piosenki "Sing It Back", stworzonym przez DJ-a Borisa Dlugoscha oraz hitem "The Time Is Now", który dotarł do 2. miejsca listy przebojów w UK, stając się tam największym sukcesem komercyjnym grupy wśród singli. Ostatnia płyta, Statues (2003), która spotkała się z pozytywnym przyjęciem krytyków i słuchaczy, to już dzieło o charakterze pop-rockowym. Po nagraniu albumu w 2003, działanie zespołu zostało zawieszone. Jak twierdzi sama Murphy, Moloko nie zostało rozwiązane, aczkolwiek nie zanosi się w najbliższym czasie na to, by powstać miała nowa płyta. W 2005 wokalistka zespołu nagrała solową płytę Ruby Blue. W czerwcu 2006 roku ukazała się składanka pt.