W 1989 była jedną z osób zakładających „Gazetę Wyborczą”, w której objęła stanowisko zastępczyni redaktora naczelnego. Wspólnie z Juliuszem Rawiczem wymyśliła slogan „Wasz prezydent, nasz premier”. W czasie tzw. wojny na górze opowiedziała się po stronie Tadeusza Mazowieckiego przeciwko Lechowi Wałęsie. W latach 1990–1998 zajmowała stanowisko prezesa przedsiębiorstwa Agora-Gazeta, następnie do 2004 była zastępczynią prezesa zarządu Agory. W kwietniu 1999 objęła pakiet około 1,7 mln akcji wyemitowanych przez Agorę o wartości około 80 mln zł, stając się jedną z najbogatszych Polek. Weszła równocześnie do pięcioosobowego zarządu holdingu Agora. Jej poglądy ewoluowały do tego czasu od lewicujących do wolnorynkowych, określiła się jako zwolenniczka Margaret Thatcher. Od 2004 do 2007, w związku z chorobą Adama Michnika, faktycznie kierowała redakcją „Gazety Wyborczej”. W 2009 przeszła na emeryturę.
W 2002, 2004 i 2005 była notowana na liście najbogatszych Polaków tygodnika „Wprost”.
Wyróżnienia i upamiętnienie W 1989 otrzymała nagrodę im. za sumienność i uczciwość w dziennikarstwie, przyznawaną przez przy Uniwersytecie Harvarda, a w 1999 została wyróżniona Knight International Press Fellowship Award przez .