Thomas Wolter (ur. 4 października 1963 w Hamburgu) – były niemiecki piłkarz. Występował na pozycji obrońcy. Obecnie jest trenerem rezerw Werderu Brema.
Kariera klubowa Wolter jako junior grał w drużynach TuS Ottensen oraz HEBC Hamburg. W 1984 roku trafił do Werderu Brema, który był jego pierwszym profesjonalnym klubem w karierze. W jego barwach zadebiutował 24 listopada 1984 w wygranym przez jego zespół 4-1 pojedynku z Eintrachtem Brunszwik, rozegranym w ramach rozgrywek Bundesligi. Łącznie w sezonie 1984/1985 rozegrał trzy mecze w lidze. Z klubem został także wicemistrzem Niemiec. Od początku sezonu 1985/1986 był podstawowym graczem składu Werderu. Pierwszego gola w zawodowej karierze strzelił 31 sierpnia 1985 w wygranym przez Werder spotkaniu z Hamburgerem SV. W 1986 roku ponownie został wicemistrzem Niemiec. W 1988 roku Wolter zwyciężając z klubem w rozgrywkach Bundesligi, został mistrzem Niemiec. Rok i dwa lata później bremeńczycy wystąpili w finale Pucharu Niemiec, ale zostali tam pokonani przez najpierw Borussię Dortmund, a w 1990 przez 1. FC Kaiserslautern. W 1991 roku udało im zwyciężyć w Pucharze Niemiec, po wygraniu w rzutach karnych z 1. FC Köln. W 1992 roku, po pokonaniu 2-0 AS Monaco, zdobyli Puchar Zdobywców Pucharów.