W strukturę rady włączone zostały oddziały naukowe Głównego Szpitala Wojskowego na Ujazdowie: anatomii patologicznej i medycyny sądowej, antropologiczny, bakteriologiczny, chemiczny, farmakologiczny, higieny i statystyki, radiologiczny i rentgenologiczny oraz oddziały kliniczne: chirurgiczny, medycyny wewnętrznej, skórno-weneryczny, chorób uszu i gardła, nerwowy i psychiczny, chorób oczu i zakaźny. Ponadto w skład rady wchodziła kancelaria, redakcja "Lekarza Wojskowego", biblioteka, komisja gospodarcza i tabor.
27 sierpnia 1921, w związku z wprowadzeniem pokojowej organizacji służby zdrowia, Wojskowa Rada Sanitarna przemianowana została na Wojskowy Instytut Sanitarny.
1 kwietnia 1930 zorganizowane zostało Centrum Wyszkolenia Sanitarnego. Przy centrum powołana została Wojskowa Rada Sanitarna jako organ doradczy, opiniodawczy i naukowy szefa Departamentu Sanitarnego (Zdrowia) Ministerstwa Spraw Wojskowych. W skład rady wchodzili: komendant CWSan. - przewodniczący, komendant Szpitala Szkolnego CWSan. - zastępca przewodniczącego, dyrektor nauk CWSan. - sekretarz, zastępca szefa Departamentu Sanitarnego (Zdrowia) M.S.Wojsk. - członek zwyczajny, szef sanitarny Okręgu Korpusu Nr I - członek zwyczajny, komendant Szkoły Podchorążych Sanitarnych - członek zwyczajny, kierownicy naukowi oddziałów Szpitala Szkolnego CWSan.