Organizatorzy i darczyńcy pamiątek zdecydowali o przedłużeniu wystawy, a w końcu – o utworzeniu stałego muzeum. Po uroczystościach 10-lecia WAM zbiory wystawy przeniesiono do innej sali także przy ul. Źródłowej, gdzie funkcjonowała ona do 1972 roku pod kierownictwem płk. dr. hab. Stefana Wojtkowiaka jako sala tradycji WAM.
Następnie eksponaty trafiły do gmachu przy ul. Żeligowskiego, do muzeum tworzonego przez ówczesnego zastępcę a później komendanta WAM płk prof. dr hab. n. med. Tadeusza Brzezińskiego, późniejszego rektora Pomorskiej Akademii Medycznej w Szczecinie. Formę architektoniczną i układ ekspozycji zaprojektował zespół Państwowej Wyższej Szkoły Sztuk Plastycznych (obecnej Akademii Sztuk Pięknych im. Władysława Strzemińskiego) w Łodzi pod kierunkiem jej ówczesnego rektora prof. dr. Zdzisława Głowackiego.
Uroczystego otwarcia Muzeum, któremu nadano nazwę Muzeum Polskiej Wojskowej Służby Zdrowia, z kilkakrotnie powiększoną ekspozycją, dokonał 22 stycznia 1972 roku komendant – rektor WAM gen. bryg. prof. dr med. Wiesław Łasiński.