Rozgrywki rosyjskiej Premier Ligi w sezonie 2006 były piętnastymi w historii rosyjskiej pierwszej ligi. Rozpoczęły się 17 marca 2006 roku meczem FK Moskwa z Amkarem Perm (1:0), zakończyły się natomiast 26 listopada 2006 roku. W rozgrywkach wzięło udział szesnaście drużyn, w tym dwie, które awansowały z Pierwszej Dywizji – Łucz-Eniergija Władywostok i Spartak Nalczyk. Mistrzowski tytuł wywalczyła drużyna CSKA Moskwa. Królem strzelców ligi został Roman Pawluczenko ze Spartaka Moskwa, który zdobył 18 goli.
Drużyny
DrużynaMiastoTrenerStadionPojemnośćPozycja w 2005Perm Raszid RahimowZwiezda Stadion20,000Moskwa Walerij GazzajewŁużniki84,745Moskwa Andriej KobielewStadion Dinamo36,540Samara Gadży GadżyjewStadion Mietałłurg33,220Moskwa Oleg DołmatowStadion Lokomotiwu28,800Władywostok Siergiej PawłowStadion Dinamo 10,000Moskwa Leonid SłuckiStadion im.