Transport Jakuck położony jest na lewym brzegu Leny. Z resztą rosyjskiej sieci drogowej jest połączony poprzez prom, kursujący latem, oraz rzeką Lenę, przez którą możliwy jest przejazd zimą, kiedy jest zamarznięta. Miasto posiada dwa lotniska:
Port lotniczy Jakuck (lotnisko międzynarodowe) Port lotniczy Magan (lotnisko regionalne)
Na prawym brzegu Leny obok Jakucka znajduje się miejscowość Niżnij Biestiach, które leży w pobliżu skrzyżowania 3 głównych autostrad w okolicy. Ma dworzec autobusowy i kolejowy.
Planowane jest połączenie kolejowe z Koleją Bajkalsko-Amurską (BAM), zarówno do Jakucka właściwego, jak i – bez przeprawy przez Lenę – do Niżnego Bestiachu. Po wybudowaniu pierwszego mostu, 3-kilometrowego drogowo-kolejowego; budowa miała trwać w latach 2009–2013 w okolicy wsi Stara Tabaga 40 km na południe od miasta, ale została odłożona poza 2020 roku. ze względu na przerzucenie środków na budowę mostu w Cieśninie Kerczeńskiej. Północna odnoga BAM-u została dociągnięta 260 km na południe od Jakucka, nieco na północ od Tommotu, Republic of Sakha Information Portal, 29 marca 2007, przedruk artykułu prasowego (autor: Aleksey Dmitriev, gazeta: Yakutia). Link sprawdzony 2008-01-13.