miał dwoje dzieci – Tomasza i Julię. Mieszkał w Wielkim Kacku.
Zmarł na skutek COVID-19 w okresie światowej pandemii tej choroby. Msza pogrzebowa została odprawiona 27 marca 2021 (w Międzynarodowy Dzień Teatru) w kościele św. Jana w Gdańsku. Jerzy Limon został pochowany na cmentarzu komunalnym w Sopocie (sektor P5/2/6).
Publikacje Münchhauseniada, Wydawnictwo Poznańskie, Poznań 1980, . Gdański teatr „elżbietański”, Zakład Narodowy im. Ossolińskich, Wrocław 1989. Wieloryb. Wypisy źródłowe, Wyd. Jama s.c., Gdańsk 1998, . Koncert Wielkiej Niedźwiedzicy, Wyd. „Twój Styl”, Warszawa 1999, . Między niebem a sceną. Przestrzeń i czas w teatrze, Wyd. Słowo/obraz terytoria, Gdańsk 2002, . Trzy teatry: scena, telewizja, radio, Wyd. Słowo/obraz terytoria, Gdańsk 2003, . Piąty wymiar teatru, Wyd. Słowo/obraz terytoria, Gdańsk 2006, . Obroty przestrzeni. Teatr telewizji. Próba ujęcia teoretycznego, Wyd. Słowo/obraz terytoria, Gdańsk 2008, . Brzmienia czasu. O aktorstwie i mowie scenicznej, Wyd. Słowo/obraz terytoria, Gdańsk 2011, . Młot na poetów albo Kronika ściętych głów, Wyd. Słowo/obraz terytoria, Gdańsk 2014. Szekspir. Siedem grzechów głównych (z zarazą w tle), Wyd.