W tym sezonie odbyła się pierwsza edycja Tour de Ski. Z planowanych ośmiu konkursów rozegrano sześć. Dwa pierwsze starty odwołano z powodu braku śniegu w Novym Měście. Impreza zakończyła się zwycięstwem wśród kobiet Virpi Kuitunen oraz Tobiasa Angerera wśród mężczyzn.
Po raz pierwszy w historii Pucharu Świata Polka zwyciężyła w konkursie. Justyna Kowalczyk 27 stycznia 2007 roku w estońskim Otepää wygrała w biegu na 10 kilometrów stylem klasycznymPierwsze zwycięstwo Justyny Kowalczyk na stronie Rzeczpospolita.pl.
Zwycięzcy Kobiety
Mężczyźni
Kalendarz i wyniki Kobiety Lp.MiejscowośćDystansData1. miejsce2. miejsce3. miejsce1. DüsseldorfSprint s. dowolnym28 października 2006 Marit Bjørgen Natalja Matwiejewa Ella Gjømle2.Sprint drużynowy s. dowolnym29 października 20063. Gällivare10 km s. dowolnym18 listopada 2006 Kateřina Neumannová Kristina Šmigun Marit Bjørgen4.Sztafeta 4×5 km19 listopada 20065. RukaSprint s. klasycznym25 listopada 2006 Petra Majdič Virpi Kuitunen Marit Bjørgen6.10 km s. klasycznym26 listopada 2006 Virpi Kuitunen Marit Bjørgen Kristina Šmigun7. Cogne/Valle d’AostaSprint s. dowolnym8 grudnia 2006odwołany8.15 km bieg łączony10 grudnia 2006odwołany7. Cogne10 km s. klasycznym13 grudnia 2006 Virpi Kuitunen Petra Majdič Aino-Kaisa Saarinen8. La Clusaz15 km s.