Mateusz Kowalski (ur. 30 września 1986 roku w Krakowie) – polski piłkarz. Zakończył karierę grając w Flint Fotball.
Kariera klubowa Początki kariery Mateusz Kowalski swoją przygodę z piłką nożną zaczynał w drużynie trampkarzy Wisły Kraków. W 2005 roku Kowalski występował z drużyną juniorów starszych Wisły na finałowym turnieju Mistrzostw Polski rocznika 1986. Na turnieju zagrał we wszystkich trzech meczach w podstawowym składzie i zdobył jedną bramkę w spotkaniu z juniorami Górnika Łęczna. Drużyna Wisły uplasowała się na czwartym, ostatnim miejscu w tabeli turnieju.
Wypożycznie do Kolejarza Stróże W 2005 roku Kowalski został wypożyczony na dwa lata do Kolejarza Stróże. Swoją pierwszą bramkę dla Kolejarza w rozgrywkach II Ligi zdobył 2 października, w wyjazdowym spotkaniu z Avią Świdnik. Było to jego jedyne trafienie w sezonie 2005-06. W sezonie 2006-07 Kowalski zdobył w barwach Kolejarza dwie bramki w lidze. Kolejarz zajął w tym sezonie drugie miejsce w ligowej tabeli, przez co zagrał w barażach o awans do wyższej klasy rozgrywkowej. Przeciwnikiem drużyny ze Stróż była Stal Stalowa Wola. Kolejarz pomimo zwycięstwa w pierwszym meczu 2-0, drugie spotkanie przegrał czterema bramkami przez co nie wywalczył awansu do I Ligi.