W skład uposażenia wchodziła pobliska wieś Jarużyn, łąki z jeziorem nad Brdą i Wisłą, wyspa (łacha) u ujścia Brdy zwana Stara Dbrzyca oraz dziesięciny z dwóch wsi: Orłowa i Siedlec.
Świątynia początkowo podlegała biskupowi gnieźnieńskiemu bądź płockiemu, a po erygowaniu diecezji kujawsko-pomorskiej w 1124 r. – biskupowi włocławskiemu. Kościół pierwotny pod wezwaniem św. Marii Magdaleny stał obok kasztelańskiego grodu w pobliżu Wisły. Jego kościołem filialnym był prawdopodobnie bydgoski kościół grodowy pw. św. Idziego (rozebrany w 1879 r.).
Pierwsza bezpośrednia wzmianka pisana o parafii wyszogrodzkiej pochodzi z 1325 r.Wykaz parafii z 1325 i 1327 r. na obszarze obecnego powiatu bydgoskiego wymienia jedynie parafie w Wyszogrodzie i Dobrczu, co nie przekreśla jednak możliwości istnienia ich większej liczby Obejmowała ona wtedy osiem miejscowości: Jasiniec, Siernieczek, Jarużyn, Czersko, Strzelce, Włóki, Osielsko i ŻołędowoGuldon Zenon: Podziały administracyjne Kujaw i ziemi dobrzyńskiej w XIII–XIV wieku: Warszawa, Poznań : Państwowe Wydawnictwo Naukowe, 1974.