Rodzina Bogusław VI był dwukrotnie żonaty. Pierwszą żoną była Judyta (Juta), córka , księcia sasko-lauenburskiego i Agnieszki holsztyńskiej. Z tego związku miał dwie córki: Zofię (ur. przed lub w okr. 1380–1381, zm. ok. 1408) – żonę , syna Albrechta, króla Szwecji i oraz , księcia meklemburskiego z linii Werle na Waren, Agnieszkę (ur. w okr. 1381–1388, zm. przed 1430?) – żonę Konrada Starszego, pana von Tannrode na StraußfurcieW starszej literaturze przedmiotu istniał pogląd, że Agnieszka była również małżonką Baltazara, pana na Werle–Güstrow (T. Kantzow, R. Klempin, A. Hofmeister). Współczesne badania genealogiczne odrzucają informację o mariażu, skłaniając się do uznania jedynie narzeczeństwa (E. Rymar).E. Rymar, Rodowód książąt pomorskich, ss. 362-365..
Drugą małżonką natomiast była Agnieszka, córka Magnusa II, księcia brunszwickiego i lüneburskiego i Katarzyny Anhalt-Bernburg. Dawna literatura przedmiotu przypisywała temu małżeństwu dwie znane córki Bogusława VI, tj.: Zofię i Agnieszkę, które według nowszych ustaleń pochodzą z pierwszego małżeństwa z Judytą.
Genealogia