gen. armii Jurij Maksimow - 10.7.85 - 19.8.92; marszałek Federacji Rosyjskiej Igor Siergiejew - 19.8.92 - 22.5.97 gen. armii Władimir Jakowlew - 6.97 - 27.4.01 gen. płk Nikołaj Sołowcow - 27.4.01 - 3.8.09 gen. por. Andriej Szwajczenko - 3.8.09 - 22.6.10 gen. płk. Siergiej Karakajew - od 22 czerwca 2010
Sztab składa się z odpowiedzialnych za poszczególne działy Zarządów:
Zarząd Operacyjny Sztabu Głównego - odpowiedzialny za dowodzenie operacyjne i kontrolę nad jednostkami bojowymi oraz planowanie w zakresie działań bojowych; Główny Zarząd Uzbrojenia Rakietowego (GURWO) - kierowany przez Zastępcę Dowódcy ds. uzbrojenia, odpowiedzialny jest za dokonywanie wyborów specyfikacji systemów rakietowych, wsparcie dla przemysłu w zakresie rozwoju nowych pocisków i systemów rakietowych oraz testy systemów i pocisków. Zarząd ten kieruje także instytutami naukowymi Wojsk Rakietowych Przeznaczenia Strategicznego oraz ich polami testowymi; Główny Zarząd Służb Technicznych Broni Rakietowej i Urządzeń (GUERWO) - odpowiedzialny za bieżący serwis i utrzymanie techniczne systemów rakietowych; Zarząd Treningu Bojowego i Wojskowych Instytucji Akademickich - kierowany przez Zastępcę Dowódcy ds. wyszkolenia bojowego, odpowiedzialny za szkolenie personelu wojsk rakietowych.