Janusz Marek Bujnicki (ur. 6 sierpnia 1975 w Krakowie) – polski biolog specjalizujący się w doświadczalnej i obliczeniowej biologii strukturalnej, profesor nauk biologicznych, kierownik Laboratorium Bioinformatyki i Inżynierii Białka w Międzynarodowym Instytucie Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie.
Życiorys W 1998 ukończył studia na Wydziale Biologii Uniwersytetu Warszawskiego, gdzie w 2001 uzyskał stopień doktora nauk biologicznych. W latach 1998–2000 odbył staż w Szpitalu Henry’ego Forda w Detroit w USA, a w 2001 w Narodowym Centrum Informacji Biotechnologicznej (NCBI) amerykańskich Narodowych Instytutów Zdrowia (NIH) w Bethesdzie. W 2008 był profesorem wizytującym na Uniwersytecie Tokijskim.
Pracę w Międzynarodowym Instytucie Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie rozpoczął w 1999, w 2002 objął kierownictwo Laboratorium Bioinformatyki i Inżynierii Białka. W latach 2004–2020 pracował również w Instytucie Biologii Molekularnej i Biotechnologii na Wydziale Biologii UAM, gdzie od 2006 był kierownikiem grupy Laboratorium Bioinformatyki Strukturalnej.
W 2005 uzyskał habilitację w Instytucie Biochemii i Biofizyki PAN w zakresie biologii. W 2009 otrzymał tytuł profesora nauk biologicznych.