Z kolei w Szeregowcu Ryanie Stevena Spielberga zagrał charakterystyczną rolę jednorękiego oficera.
W 1999 napisał scenariusz i wyreżyserował film Last Chance. Cranston jest także reżyserem kilku odcinków Zwariowanego świata Malcolma. Za rolę w tym serialu otrzymał trzy nominacje do Nagrody Emmy.
Cranston często występował gościnnie w serialach. Te najbardziej znane to m.in.: Sabrina, nastoletnia czarownica, Z Archiwum X, Babilon 5 czy Gliniarz i prokurator. Sympatię widzów i grono fanów przysporzyła mu rola dr Tima Whatleya w serialu Kroniki Seinfelda.
Grał główną rolę w serialu Breaking Bad, gdzie wcielał się w Waltera White’a, producenta metamfetaminy. W 2008 roku Cranston zdobył pierwszą Nagrodę Emmy dla najlepszego aktora za rolę w Breaking Bad. Po niej przyszły kolejne, a rola White’a okazała się przełomem w jego karierze. Po latach zagrał go jeszcze w El Camino: Film Breaking Bad i Zadzwoń do Saula - spin-offach Breaking Bad.
Życie prywatne 10 listopada 1977 ożenił się z pisarką Mickey Middleton, lecz 8 kwietnia 1982 doszło do rozwodu.